Los mejores CRM con facturación para una pyme española son los que guardan la ficha del cliente, el seguimiento comercial y la factura en el mismo sitio, cumplen VeriFactu y tienen un precio que no se dispara al sumar usuarios. En esta comparativa revisamos Holded, Odoo, STEL Order y Zoho con datos de sus webs oficiales.
Si has llegado hasta aquí, probablemente ya sabes lo que cuesta tener la venta en un sitio y la factura en otro: el comercial anota al cliente en su herramienta, cierra la operación y alguien de administración vuelve a teclear el NIF, la dirección fiscal y el descuento pactado en el programa de facturación. El mismo cliente, dos veces, y cada copia envejece por su cuenta.
La solución lógica es un CRM con facturación: un único programa en el que la ficha comercial y la ficha de facturación son la misma. El problema es elegir. Casi todos los fabricantes dicen que su producto «también factura», pero no todos lo hacen igual: unos traen la facturación de serie, otros la conectan con una aplicación aparte y otros apenas tienen seguimiento comercial. Esta guía compara los mejores CRM con facturación con los criterios que de verdad separan a unos de otros.
Cómo hemos comparado los mejores CRM con facturación
Hemos elegido cuatro programas con presencia real en pymes españolas. El nuestro, VertebraPyme, no está en la tabla porque no es un CRM; más abajo contamos qué hace y qué no. No hemos puntuado ni ordenado de mejor a peor: cada uno encaja en un tipo de empresa distinto, y lo útil es saber cuál encaja con la tuya. Estos son los cinco criterios de la tabla:
- CRM y embudo de ventas. Si el programa tiene seguimiento comercial y, en concreto, un embudo u oportunidades por etapas. No todas las pymes lo necesitan, pero conviene saber si está.
- Facturación nativa o por integración. Si la factura se emite desde el mismo programa o desde otra aplicación conectada. Es la diferencia entre una ficha de cliente y dos.
- VeriFactu y factura electrónica. Si el fabricante declara soporte para el sistema de facturación verificable de la AEAT y para la factura electrónica.
- Precio de entrada. El precio publicado del plan más bajo que da CRM y facturación a la vez, o «consultar» cuando no lo publican.
- Para quién encaja. Tamaño y tipo de empresa donde cada opción rinde mejor.
Todos los precios y funciones se han comprobado en las webs oficiales de cada fabricante el 30 de septiembre de 2026. Cuando un dato no aparece en esas webs, no lo ponemos. Los planes cambian a menudo, así que tómalos como referencia y confírmalos antes de contratar.
Tabla comparativa: 4 CRM con facturación para pymes en España
Esta es la tabla resumen de los mejores CRM con facturación que hemos revisado. Debajo tienes una ficha corta de cada uno con los casos en los que encaja y en los que no.
| Opción | CRM y embudo | Factura | VeriFactu y e-factura | Precio de entrada | Para quién encaja |
|---|---|---|---|---|---|
| Holded | CRM con embudo de ventas desde el plan Básico | Nativa, en todos los planes | VeriFactu incluido en todos los planes | Plus desde 15 €/mes + IVA; Básico, con embudo, 29 €/mes + IVA | Pymes y autónomos que quieren facturación, contabilidad y CRM en la nube |
| Odoo | Oportunidades en vista kanban por etapas | Nativa (aplicaciones Ventas y Facturación) | VeriFactu y Facturae en su localización para España, según su documentación | Una aplicación gratis; CRM + facturación en el plan Estándar, desde 11,90 € por usuario y mes con pago anual (descuento del primer año) | Empresas que quieren crecer módulo a módulo y cuentan con quien lo implante |
| STEL Order | CRM de clientes, clientes potenciales y agenda (embudo: consultar) | Nativa, con presupuestos; pedidos y albaranes desde el plan ERP Business | Compatible con VeriFactu en todos los planes, incluido el gratuito; factura electrónica incluida | Plan Free a 0 € (hasta 200 clientes); Lite 24 €/mes sin impuestos | Autónomos y pymes de servicios técnicos que trabajan en movilidad |
| Zoho CRM + Zoho Invoice | CRM con procesos y canal de ventas | Por integración con Zoho Invoice o Zoho Books | VeriFactu en Zoho Invoice a través de B2Brouter (cuenta aparte) | CRM gratis hasta 3 usuarios; Estándar 14 € por usuario y mes con pago anual | Equipos comerciales que priorizan el CRM y aceptan conectar piezas |
Datos verificados en las webs oficiales el 30-09-2026 (holded.com, odoo.com, stelorder.com y zoho.com). Precios sin IVA cuando la web lo indica; en Odoo y Zoho la web no especifica el tratamiento del IVA. Confírmalos antes de contratar.
Ficha de cada opción: para quién sí y para quién no
Una tabla ayuda a descartar, pero no a decidir. Estas fichas cuentan en qué situación brilla cada uno de estos CRM con facturación y en cuál conviene mirar otra cosa.
Holded
Holded reúne en la nube facturación, contabilidad, tesorería, inventario y CRM. Su plan más bajo, Plus, cuesta 15 €/mes + IVA, pero el embudo de ventas aparece desde el plan Básico, a 29 €/mes + IVA con 2 usuarios. Todos los planes incluyen VeriFactu y los usuarios extra cuestan 10 € al mes cada uno.
Para quién sí: pymes pequeñas y autónomos que quieren una herramienta todo en uno, bien conocida por las asesorías. Para quién no: equipos con muchos usuarios, porque el precio sube por plan y por usuario adicional, o empresas con procesos de venta muy particulares.
Odoo
Odoo es un ERP modular con un CRM completo: oportunidades en vista kanban por etapas, presupuestos y pedidos enlazados a cada oportunidad, y facturación en la misma plataforma. Tiene un plan gratuito de una sola aplicación, pero para usar CRM y facturación a la vez necesitas el plan Estándar, desde 11,90 € por usuario y mes con pago anual, precio con descuento durante el primer año. Su documentación para España incluye VeriFactu y Facturae.
Para quién sí: empresas que prevén crecer y quieren añadir inventario, fabricación o tienda online sin cambiar de sistema. Para quién no: pymes que buscan algo listo para usar sin implantador; la potencia de Odoo se paga en configuración.
STEL Order
STEL Order nace para empresas de servicios técnicos e instaladores. Su plan gratuito ya incluye clientes, CRM, presupuestos, facturación, agenda e informes, con un límite de 200 clientes, y todos los planes son compatibles con VeriFactu e incluyen factura electrónica. El plan Lite cuesta 24 € al mes sin impuestos, y los pedidos, albaranes y el servicio técnico llegan con el plan ERP Business.
Para quién sí: autónomos y pequeñas empresas que trabajan en la calle y facturan desde el móvil. Para quién no: si buscas un embudo de ventas avanzado, porque su página de precios no lo detalla; pregúntalo en la demo.
Zoho CRM + Zoho Invoice
Zoho CRM es un CRM puro muy completo, con un plan gratuito para 3 usuarios y un plan Estándar de 14 € por usuario y mes con pago anual (20 € en pago mensual). La facturación con VeriFactu no vive en el CRM, sino en Zoho Invoice o Zoho Books; en Zoho Invoice, las facturas llegan a la AEAT a través de B2Brouter, un proveedor para el que necesitas cuenta propia.
Para quién sí: equipos comerciales que viven en el CRM y quieren automatizar el seguimiento de clientes. Para quién no: pymes que quieren una sola ficha de cliente sin gestionar integraciones entre aplicaciones y proveedores.
¿Y VertebraPyme?
Para ser transparentes: nuestro programa no está en la tabla porque hoy no es un CRM. VertebraPyme es un programa de facturación y ERP: lleva la ficha de clientes, los comerciales asignados y sus comisiones, pero no tiene tareas, calendario ni embudo de ventas.
Si lo que necesitas es facturar y controlar cobros, mira VertebraPyme, nuestro programa de facturación y ERP para pymes. Si necesitas un CRM completo, cualquiera de los de la tabla lo cubre.
CRM integrado en el ERP o CRM conectado al programa de facturación
Detrás de la tabla hay dos maneras de resolver el mismo problema. La primera es un CRM integrado en el programa de gestión: Holded, Odoo y STEL Order emiten la factura desde el mismo sistema en el que vive el cliente. La segunda es conectar un CRM con el programa de facturación mediante una integración, que es el modelo de Zoho CRM con Zoho Invoice o de cualquier pyme que une su CRM actual con su programa de siempre.
Ninguna es mala. Conectar tiene sentido cuando el programa de facturación está muy asentado, la asesoría trabaja sobre él y cambiarlo cuesta más de lo que ahorra. Integrar compensa cuando hay volumen de pedidos y facturas, y cuando las condiciones comerciales cambian a menudo, porque cada descuento pactado llega solo al documento. Si todavía dudas de qué tipo de programa necesitas, repasa en qué se diferencian un ERP, un CRM y un programa de facturación.
| Aspecto | CRM integrado en el programa de gestión | CRM conectado al programa de facturación |
|---|---|---|
| Ficha del cliente | Una sola, compartida | Una en cada sistema, sincronizada |
| Estado del cobro en la ficha comercial | Visible directamente | Solo si la integración lo devuelve |
| Puntos que pueden fallar | Uno: el propio programa | Tres: cada programa y el enlace entre ellos |
| Actualizaciones | Una | Dos, y revisar que el enlace sigue funcionando |
| Encaje con la asesoría | Hay que acordar el formato de salida | Se conserva el programa que ya usa |
Lo que no funciona es la tercera vía, que es la más habitual: dos programas sin conectar y una persona haciendo de puente. Si hoy trabajas así, el primer paso no es elegir herramienta sino decidir si la ficha del cliente debe ser una sola. Contamos cómo detectarlo en la guía sobre cuándo la hoja de cálculo se queda corta para llevar clientes.
¿Qué CRM puedo usar para facturar electrónicamente?
Cualquiera de los CRM con facturación de esta comparativa sirve para facturar electrónicamente, pero conviene separar dos obligaciones que a menudo se mezclan. La primera es VeriFactu, el sistema de la Agencia Tributaria que exige que el programa registre cada factura de forma íntegra, trazable e inalterable, con un código QR verificable. Su obligatoriedad se ha aplazado a 2027, primero para sociedades y después para el resto de contribuyentes; la información oficial está en la sede electrónica de la AEAT sobre VeriFactu.
La segunda es la factura electrónica entre empresas que viene de la Ley Crea y Crece. Sus fechas reales dependen todavía del desarrollo reglamentario, así que lo prudente es no darlas por cerradas. Para facturar a administraciones públicas ya se usa el formato Facturae a través de FACe.
En la práctica, lo que debes preguntar a cualquier proveedor es sencillo: si su programa está preparado para VeriFactu, si lo incluye en el plan que vas a contratar o lo cobra aparte, y si depende de un tercero. En nuestra comparativa, Holded y STEL Order lo incluyen en todos sus planes, Odoo lo documenta en su localización española y Zoho lo resuelve con B2Brouter. Si el CRM que te gusta no factura, la pregunta pasa a ser si el programa de facturación con el que lo conectes cumple, porque la obligación recae en quien emite la factura.
Cómo elegir entre los mejores CRM con facturación según tu empresa
La mejor forma de elegir entre los mejores CRM con facturación es empezar por cómo vendes, no por el catálogo del fabricante. Estas son las situaciones que más vemos en pymes españolas:
- Vendes con un embudo largo (varias reuniones, propuestas y seguimiento durante semanas): necesitas oportunidades por etapas. Mira Odoo, Holded desde el plan Básico o un CRM puro como Zoho conectado a la facturación.
- Vendes con comerciales que toman pedidos a clientes recurrentes: lo importante es la cartera por comercial, las comisiones y que el pedido llegue a factura sin copiarlo. Para eso quizá no necesites un CRM, sino un programa de facturación con ficha de clientes, comerciales y comisiones.
- Trabajas en la calle haciendo presupuestos e instalaciones: prioriza la app y los partes de trabajo, como en STEL Order.
- Eres autónomo o una microempresa: empieza por un plan gratuito o de entrada y comprueba que VeriFactu va incluido. Si todavía no necesitas seguimiento comercial, quizá te baste un programa de facturación fácil y sencillo.
- Tus clientes te escriben sobre todo por WhatsApp: pregunta si el CRM se conecta a la API oficial de WhatsApp Business y qué cuesta; lo explicamos en la guía sobre cómo conectar WhatsApp Business con tu CRM.
- Tienes el programa de facturación muy asentado con tu asesoría: valora conectar un CRM antes que cambiarlo todo.
Antes de firmar, pide facturar una venta real de principio a fin durante la prueba: alta del cliente, pedido, factura y cobro. Si en algún paso hay que copiar un dato a mano, la integración no es tal. Y si lo que te falta es ordenar el seguimiento comercial antes que la facturación, tienes la base en nuestra guía sobre cómo gestionar clientes con un CRM en una pyme.
Preguntas frecuentes
¿Qué CRM es adecuado para pequeñas empresas?
El que resuelve cómo vendes hoy sin obligarte a pagar funciones que no usarás. Si vendes con embudo y oportunidades, busca un CRM con esas etapas; si vendes con comerciales que toman pedidos, prioriza la ficha única de cliente, la cartera por comercial y que el pedido pase a factura sin copiar datos. Comprueba siempre el precio con tu número de usuarios.
¿Qué CRM integrados con ERP usan las pymes españolas para gestionar sus ventas?
Entre los más conocidos están Holded, Odoo y STEL Order, que integran CRM y facturación en el mismo programa, y Zoho, que conecta su CRM con Zoho Invoice o Zoho Books. VertebraPyme, nuestro programa, no es un CRM: es facturación y ERP con ficha de clientes, comerciales asignados y comisiones.
¿Cómo se conecta un CRM con el programa de facturación?
Mediante una integración, nativa del fabricante o a través de su API, que sincroniza clientes y documentos entre ambos programas. Antes de montarla, define qué sistema manda en la ficha del cliente, qué datos viajan en cada sentido y si el estado del cobro vuelve al CRM. Si la integración falla a menudo, un CRM integrado en el programa de gestión suele salir más barato.
¿Hay algún CRM con facturación gratis?
Sí, con límites. STEL Order tiene un plan gratuito con CRM y facturación hasta 200 clientes, y Odoo ofrece gratis una sola aplicación, por lo que para CRM y facturación a la vez hace falta un plan de pago. Zoho CRM es gratis hasta 3 usuarios, pero la facturación va en otra aplicación. Revisa los límites antes de cargar tus datos.
¿Un CRM con facturación tiene que cumplir VeriFactu?
Si emite facturas, sí: el programa debe registrar cada factura de forma íntegra, trazable e inalterable. La obligación se ha aplazado a 2027, primero para sociedades y después para el resto. Pregunta al proveedor si VeriFactu va incluido en el plan que contratas o se paga aparte, y si depende de un servicio externo.
Conclusión
No hay un ganador único entre los mejores CRM con facturación: Holded y Odoo encajan si necesitas embudo y un todo en uno, STEL Order si trabajas en la calle, y Zoho si el CRM es lo primero y aceptas conectar piezas. Y si lo que necesitas no es un CRM, sino facturar y controlar cobros con la ficha de clientes, los comerciales y sus comisiones en el mismo programa, puedes pedir una demo de VertebraPyme a nuestro equipo.
